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Les Sorties Champignons et les Expositions d'automne 2017 sont sur le site.

N'hésitez pas à venir nombreux aux différentes sorties et manifestation organisées.

Venez à trois sorties et passez votre LABEL AMYPHAR 2017-2018 le 26 octobre 2017 pour rejoindre ainsi notre équipe de pharmaciens mycologues labélisés.

 

 

Programme de la journée

Fiche inscription à la journée ICI


Accueil (9h30-9h50)


9h50-10h: Présentation rapide de la journée (M Buée, F Le Tacon, D Sugny)


10h-10h30 Daniel Sugny
- Démarche d’élaboration de la liste d’espèces déterminantes ZNIEFF de Franche-Comté


10h40-11h10 Jean-Paul Maurice
- La génomique: outil incontournable pour les mycologues morphologistes


11h20 - 11h50 François Le Tacon
- Qu’est-ce q’une espèce ? Complémentarité de la taxonomie morphologique et de la classification
moléculaire


12h- 12h30 Francis Martin / A Kohler
- Génomique fongique. Séquençage d'un génome vs séquençage d'un barcode (et bases de données
dédiées). Avancement du projet 1000 génome (+ autres projets JGI Agaricales) et ressources
biologiques manquantes.


Pause déjeuner (12h45 - 14h15)


14h30 - 15h00 Marc Buée
- Choix des barcodes et des primers associés. Validation par des approches de communautés
artificielles. Alignements de séquences (utilisation de Blast - approche théorique).


15h10 - 15h40 Claude Murat
- importance des marqueurs moléculaires dans l'étude de la diversité des truffes (recherches
fondamentales et appliquées)


15h 50 - 16h20 Claude Husson
- Application du barcoding moléculaire dans le diagnostic phytosanitaire et la veille sanitaire des agents
pathogènes (de la paillasse à l'applications et la législation)


16h30 - 17h / 17h15 Encadrement collectif pour travaux dirigés (salle Châtaignier avec ordinateurs)
- Exploitation de séquences ITS fongique (Blast sur NCBI ou UNITE à partir d'un fichier fasta).
Interprétation d'un résultats "Blast" (e-value, % identité, etc…)


Départ entre 17h00 & 17h30.

Cet outil en ligne qui est disponible GRATUITEMENT via le site Internet MycoDB a pour but de permettre une traçabilité des espèces que le pharmacien aura identifiées au comptoir. Il sert également à extraire des données comme par exemple les champignons les plus fréquemment apportés en officine en vue d'adapter les enseignements mycologiques.

 

 

Voici les différents modes opératoires notamment pour la création de votre compte sur le site Internet MycoDB et pour se servir de l'outil en question: ajout de récoltes, modifications de récoltes...

Création d'un compte

Ajout d'une récolte

Modification d'une récolte

 

Une fois l'ajout de récoltes fait, on peut imprimer une petite "fiche" descriptive de la récolte qui sert de convention entre le pharmacien et le patient et sur laquelle figure quelques de conseils de cueillette.

 

Cet l'outil est mis en place par Madeline AMANN Étudiante à la faculté de Pharmacie de Nancy. C'est le sujet de sa thèse d'exercice sur la mycologie à l'officine​, ​sous la direction de Julien GRAVOULET (Président de l'AMYPHAR) qui s'intitule:

DÉTERMINATION DES CHAMPIGNONS A L'OFFICINE: CRÉATION D'UN OUTIL EN LIGNE POUR LE RECUEIL ET LA TRAÇABILITÉ DES ESPÈCES IDENTIFIÉES PAR LES PHARMACIENS, ANALYSE DES DONNÉES DE LA SAISON 2015-2016.

 

Nous tenons à remercier très chaleureusement Guillaume PEAN créateur du site mycodb d'avoir accepté de développer ce module spécialement pour les pharmaciens d'officine.

 

JE VOUS INVITE DONC À MASSIVEMENT UTILISER CET OUTIL QUI PERMET DE FACILITER VOTRE TRAVAIL ET DE VALORISER L'ACTIVITÉ DE MYCOLOGIE OFFICINALE.

 

 

 

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