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Programme de la journée

Fiche inscription à la journée ICI


Accueil (9h30-9h50)


9h50-10h: Présentation rapide de la journée (M Buée, F Le Tacon, D Sugny)


10h-10h30 Daniel Sugny
- Démarche d’élaboration de la liste d’espèces déterminantes ZNIEFF de Franche-Comté


10h40-11h10 Jean-Paul Maurice
- La génomique: outil incontournable pour les mycologues morphologistes


11h20 - 11h50 François Le Tacon
- Qu’est-ce q’une espèce ? Complémentarité de la taxonomie morphologique et de la classification
moléculaire


12h- 12h30 Francis Martin / A Kohler
- Génomique fongique. Séquençage d'un génome vs séquençage d'un barcode (et bases de données
dédiées). Avancement du projet 1000 génome (+ autres projets JGI Agaricales) et ressources
biologiques manquantes.


Pause déjeuner (12h45 - 14h15)


14h30 - 15h00 Marc Buée
- Choix des barcodes et des primers associés. Validation par des approches de communautés
artificielles. Alignements de séquences (utilisation de Blast - approche théorique).


15h10 - 15h40 Claude Murat
- importance des marqueurs moléculaires dans l'étude de la diversité des truffes (recherches
fondamentales et appliquées)


15h 50 - 16h20 Claude Husson
- Application du barcoding moléculaire dans le diagnostic phytosanitaire et la veille sanitaire des agents
pathogènes (de la paillasse à l'applications et la législation)


16h30 - 17h / 17h15 Encadrement collectif pour travaux dirigés (salle Châtaignier avec ordinateurs)
- Exploitation de séquences ITS fongique (Blast sur NCBI ou UNITE à partir d'un fichier fasta).
Interprétation d'un résultats "Blast" (e-value, % identité, etc…)


Départ entre 17h00 & 17h30.